Aspace-Rioja presenta una doble estructura de funcionamiento

• Una Asociativa que, con un sistema de autogobierno democrático (Asamblea General y Junta Directiva), establece las directrices de la Asociación y planifica las diferentes líneas de actuación en el futuro.
• Y otra, de Prestación de Servicios , que cuenta con una organización técnica, responsable de la gestión de los centros y servicios creados en virtud de los objetivos asociativos planteados.

Entre las dos, existe una rigurosa definición de competencias y una continua coordinación.